El 2004 y el 2005, fueron años donde no se pudo cumplir con los objetivos propuestos debido a una serie de inconvenientes y algunos errores en los manejos dirigenciales. Pero el grupo siempre se mantuvo intacto y con la misma actitud de ser protagonista en todo momento, para esto, y como venia sucediendo todos los años se realizaron algunos cambios en el plantel, en donde se incorporaron varios jugadores que le iban a dar al equipo muchas alegrías a lo largo del tiempo como lo son el caso de Gustavo “El Fiore” Videla, Cristian “El Matador” Sarmiento, Marcelo Portugal y Pablo Más,

En el 2004 con varios altibajos, donde se alternaron partidos buenos con otros no tanto se clasifico para la segunda rueda sin inconvenientes, en esta se siguió con la misma irregularidad pero como el campeonato fue muy parejo se llegó a la ultima fecha con la posibilidad de que con un triunfo se consagraba campeón, ese partido luego de empezar ganando, se complico y no se pudo mantener el resultado, de esta manera y al ser muy parejo este campeonato, como ya hemos dicho, se perdió quedando el equipo en un cuarto puesto, que hasta el momento era la peor posición de la historia.
El 2005 fue el año mas complicado de la historia del celeste, acá por una mala decisión de los dirigentes el equipo pudo llegar a perder hasta la categoría debido a la mala inclusión de un jugador, luego de una serie de reuniones y presentación de notas se logro mantener la categoría, donde los dirigentes fueron suspendidos por una año y medio como delegados y jugadores. Y al equipo, que venia puntero cómodo a 4 puntos del segundo se le aplico una sanción que fue la quita de 9 puntos y paso a la cuarta posición, faltando dos partidos por jugar. La decepción del plantel fue total, los últimos partidos no quería ir nadie a jugar y se termino el campeonato en el sexto puesto, posición que también dejo al equipo fuera de la participación de la primera edición de la copa “Challenger Domingo J. Pantano” que unía a los primeros cuatro equipos de cada categoría.

En estos momentos es muy importante destacar la participación de los referentes del grupo y los jugadores más eternos del plantel, porque fueron ellos los encargados de levantar el autoestima de los jugadores luego de semejante frustración y unir nuevamente las fuerzas para encarar un nuevo año con todo. No fue fácil pero se hicieron muchas cosas que sirvieron para alimentar el hambre de gloria nuevamente después de dos años sin conseguir nada.

El 2006, como se dijo anteriormente iba a ser especial para todos los integrantes de este equipo, debido a los golpes sufridos el año anterior y por los objetivos que se había propuesto todo el plantel, en este año se iban a realizar pocas incorporaciones, pero algunas para destacar como lo son el caso de Gustavo Mut proveniente del ya desaparecido Arquitectura, Sergio “Checho” Bajinay, Cristian “Cañón” Ortiz, Leo “El Pendejo” Lorenzo y Pablo Menin. En este año Agrimensura iba a recobrar nuevamente la memoria, logrando una campaña inigualable hasta el momento, ganando de punta a punta el campeonato y el súper 9, dándole el derecho de jugar la segunda edición de la copa Challenger, la cual también se la adjudicaría tras vencer en la final por penales, al conjunto de Urbano F.C. después de salir empatados sin goles en el partido. Fue un año a toda orquesta donde el “Celeste”, se consagró Campeón Invicto edición 2006 de la Liga Universitaria, postergando esta racha hasta el año siguiente con un total de 36 partidos invictos, algo que nadie en la historia de la Liga ha logrado igualar hasta el momento.

Equipo de Agrimensura FC - Campeón Copa Challenger Categoría "A" - Año 2006.

En el 2007, como es costumbre y para ir renovando el plantel de manera que siempre sea competitivo, se incorporaron nuevos jugadores para fortalecer las líneas más descompensadas, como Javier “Cañoncito” Ortiz y Matías “Tutte” Tudelas estos de carácter libre.

Este año las cosas no iban a salir como lo planeado, donde el equipo volvió a tener muchos altibajos, haciendo un campeonato muy pobre y sin ni siquiera quedar entre los primeros cuatro del campeonato, pero debido a que era el último campeón de la última edición de la Copa Challenger esto lo clasifico de manera automática dejando de lado a Urbano ubicado en la 4ta posición de la general y justamente el mismo equipo al que le había ganado la final del 2006 de dicha copa.
Ya una vez en la copa Challenger edición 2007 agrimensura sacó a relucir nuevamente todo su poderío y experiencia para ganarle la final por 2 a 1 al conjunto de C-Lesión FC y así lograr el Bicampeonato en sus dos primeras participaciones.
 

En el 2008 llegó una nueva generación de jugadores al celeste, con muchas ganas de ganar cosas, y no dejó de ser así, donde agrimensura logro su campeonato número cinco y su tercer copa Challenger ganada de forma consecutiva. Este año sirvió para que muchos jugadores se afianzaran más en el plantel al igual que se contó nuevamente con la participación de los eternos, Mariano “Pichu” Gómez y Fernando “Gato” López, dos emblema del celeste, que supieron ganar todo a lo largo de la historia de Agrimensura.

Fue un campeonato que se ganó con total justicia, ganando el campeonato y luego el súper 9 sin ningún inconveniente y luego el TRICAMPEONATO de la copa Challenger ganando la final por penales al conjunto de Alianza Universitaria, y de esta manera, por la reglamentación de la misma que dice “el equipo que gane la copa 4 veces salteadas o 3 veces consecutivas se quedara automáticamente con la original”, así el glorioso “CELESTE” en sus tres primeras participaciones logro un nuevo record en su corto periodo de vida, “LA OBTENCION DEL ORIGINAL DE LA COPA CHALLENGER DEBIDO AL TRICAMPEONATO OBTENIDO EN LAS TRES PRIMERAS PARTICIPACIONES EN DICHA COMPETENCIA” 
En el resumen final del año se puede resaltar que fue donde se saco la mayor cantidad de puntos gracias a la gran cantidad de triunfos, con muy pocos empates y solamente una derrota.



Equipo de Agrimensura FC - Campeón Categoría "A" - Año 2008.

De esta manera se termina de resumir la Historia de unos de los Equipos mas ganadores en la Liga Universitaria y con la fe de poder seguir escribiendo paginas de gloria.